上海复旦复华药业有限公司是以复旦大学为背景的中国大陆第一家高校股份制上市公司——上海复旦复华科技股份有限公司的控股子公司，主要从事中成药、化学药、基因工程药物的研发、生产和销售，下设新药研发中心、红旗制药厂、质量管理中心、医药销售公司、环亚药业有限公司等部门。
位于上海市闵行区的新厂区占地33000平方米，是严格按照GMP要求建设和管理的现代化工厂，现有固体制剂（片剂、胶囊剂）、针剂（冻干粉针剂、小容量注射剂）、中药提取、包装、原料药等5个车间。目前已形成拥有自主知识产权的以天然药物特别是植物药为特色的系列产品。主要产品有：双益平、氟他胺片、雷公藤多苷片、枸橼酸他莫昔芬片、注射用还原型谷胱甘肽、注射用甲磺酸酚妥拉明等。
公司1992年被评为全国高校十佳明星企业，1993年起至今连续10年被评为上海市高新技术企业。2000年11月冻干粉针剂通过国家食品药品监督管理局（SFDA）的GMP认证；2002年12月，片剂（含抗肿瘤药）、胶囊剂、小容量注射剂通过SFDA的GMP认证；2004年5月，原料药也顺利通过SFDA的GMP认证。至此，上海复旦复华药业有限公司整体通过GMP认证。公司将全面启动ERP管理，使公司的信息化管理跃向新台阶。
公司具有一批年轻有为、敢于创新、敢为人先、有良好技术底蕴的骨干人才。以科技为先导，以服务大众为己任，作为具有高校背景的高科技企业，复华药业将继续依托复旦大学的雄厚科研实力和上市公司的资金、管理优势，把握市场机会，把企业做特做强，为社会贡献更多的好药新药，为民族医药的腾飞奉献自己的力量。