深圳市龙岗区是深圳市城市副中心，是深圳市东进战略的核心区和主战场。北京中医药大学深圳医院（龙岗）坐落在龙岗大运新城片区，毗邻国际大学园、大运中心、深港国际中心，位于“城市新客厅”中轴位置。
医院创建于2012年12月28日，全国最年轻三甲中医医院，曾以5年时间创下三甲而创造中医院发展史的“深圳速度”。现为北京中医药大学第五临床医学院（直属），将于2020年成立中医医疗集团，下设五家分院，60余家社康中心。
2018年医院被国家中医药管理局确定为全国中医药改革重要试点，率先在全国提出“三共享、两获得、一满意”的改革目标，为全国基层中医药改革探索“龙岗模式”。
医院现有占地面积6万平方米，建筑面积8万平方米，开放床位数550张，职工1100余人。筹建中的新医疗综合大楼，建筑面积9万平方米，拟新增床位规模600张。