乌鲁木齐市中医医院始建于1960年，是由乌鲁木齐市人民政府举办的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的现代化综合性三级甲等中医院，是新疆医科大学附属医院、北京中医药大学共建医院、西安医学院实习医院，是国家级的中医类别医师资格实践技能考试基地、中医住院医师规范化培训基地、高层次人才培养基地建设单位。
乌鲁木齐市中医医院一院三址（总院位于乌鲁木齐市中心的友好南路、南门分院位于南门解放南路、小十字分院位于解放北路），总占地面积为14943平方米，总建筑面积6.4万平方米，医院开放床位750张，临床科室32个，拥有各种常见的大型先进医疗设备。
多年以来，医院在发展上始终坚持中医药的特色和优势，并在传承的基础上进行不断的探索和创新。目前，拥有国家级名老中医药传承工作室4个，国医大师工作室分站3个，市级名医工作室3个。医院现有国家中医药管理局重点专科1个（内分泌科）、国家中医药管理局重点专科协作组成员单位3个（妇科、肛肠科、老年病科），自治区中医重点学科1个（中医内分泌科）、自治区中医重点专科9个（内分泌科、脑病科、妇科、肺病科、针灸科、肛肠科、心病科、脾胃病科、肾病科）、自治区重点专科培育项目单位3个（骨伤科、老年病科、康复科）。